Вообще, вы второй контроллер держите именно затем, чтобы можно было в случае падения первого перенести роли и спокойно восстанавливать.
Имхо, восстановление из бэкапа, в данном случае, будет злом, вы получите только проблемы с репликацией данных АД.
Лучше всего, если на поломанном кд остались какие-то важные сервисы, восстановить его без сети из бэкапа, выгрузить сервисы. Затем - переустановка(Роли на втором всё это время). После возвращения первого, роли можно и обратно.
Если сервисов нет, только КД - спокойно все роли на второй, переустановка первого, затем разнесение ролей как нравится.