Ваша проблема заключается в том, что вы сделали изменения в одной ветке (скажем в мастере) закоммитили в мастере. А потом перешли в ветку dev.
Конечно там уже не будет ваших изменений. Нужно было вначале перейти в dev, а потом уже делать изменения и коммитить.
Чтобы исправить вашу проблему и перенести коммит из одной ветки в другую, вам понадобится команда cherry-pick.
Мануал.