Для рабочего места инструментов полно, тот же draw.io или MS Visio. Но для меня лично чаще возникает необходимость быстро, а главное удобно, набросать схему где-то в кафе или метро. Потом всегда можно переместить в серьезный документ, если идея найдёт продолжение. Так вот в моем случае я использую DrawExpress. Это приложение простое до безобразия. Максимум управления сводится к рисованию фигур пальцем, тут же преобразующихся в более правильную форму.