Я делаю так.
до 500 мег под /boot
далее создаю LVM на котором ставлю
/
/home
/log
swap
Но важным является то, что я не выделяю всё свободное место, а только необходимое плюс небольшой запас. С таким подходом пока имеется свободное место на LVM имеется возможность сделать lvresize и resize2fs прямо на ходу не перегружая систему.
Диски для виртуалон же выделяю прямо в LVM.