Насчет утилит мониторинга.
В простейшем случае - монитор ресурсов. Смотрите что, кто и куда пишет.
Если что посерьезней - качайте набор утилит от Марка Руссиновича, там есть неплохой монитор.
А вообще в windows начиная с семерки вся деятельность по обслуживанию системы должна выполнятся в фоновом режиме.
Т.е дефрагментация и прочая оптимизация дисков, проверка и установка обновлений и прочее выполняется автоматически как только компьютер начинает простаивать.
Дефрагментация не включена, различные проверки на вирусню тоже.
Вы зашли и специально их отключили? Так?
По умолчанию они включены.