Так в итоге, был договор или нет.
Могу я в судебном порядке доказать кражу исходных кодов заказчиком?
С такими вопросами к юристам, причем специализирующимся на IT. При наличии денег, в судебном порядке можно доказывать все что угодно, с переменным успехом.
Для начала, вы и заказчик физлицо, ИП или ООО и где находитесь.
UPD автору вопроса похоже уже не надо, но в общем есть всякие шаражные "экспертные" учреждения. Если в одном из них вы закажите экспертизу, в которой вам напишут, что вы разработали этот код несколько месяцев назад и код разработали на вашем ПК, с этой "экспертизой" (если конечно кто-то такую сделает) и адвокатом вы можете теоретически пойти в суд и что-то доказать.
Экспертиза называется "экспертиза авторских прав на программу" гугл по этому запросу выводит пару шаражек.