имеется ли смысл делить его на разделы если диск по факту все равно один
Удобство в работе. Как структурно - нет свалки всего на одном диске, так и технически.
Вы можете сделать образ небольшого диска C: и хранить его в т.ч. на D:. Если будет какой-то логический сбой, вы быстро сможете откатить систему к рабочему состоянию со всеми настройками и программами.
Рабочие файлы при этом затронуты не будут.
P.S.
Единственное, что я бы добавил, это оцените трезво размер нужного вам системного диска, чтобы создать его раз и навсегда.
Различными resize'рами, тем более наживую, я бы пользоваться не советовал. С очень давних времён пользователи подобных программ регулярно становятся нашими клиентами.