Если используется система видеонаблюдения (СВ), то потенциально результат ее работы она может повлиять на индексацию:
допустим, множество мелких видеофайлов или, наоборот, небольшое количество крупных видеофайлов.
1. Стоит исключить директории, куда СВ пишет временные файлы. Если пойти дальше, то попробовать отключить от индексайии все директории с видеофайлами, а затем проверить что происходит с местом на диске и пошагово возвращать директории обратно, проверяя.
2. Хранить видео на отдельном диске от системы.
3. Стоит глянуть в логи СВ и винды. Может, будет что-то интересное.