Высверливать шляпку винта сверлом, диаметром таким же как внешняя часть резьбы винта (сначала сверлим заведомо меньшим диаметром, потом основным диаметром).
Самое главное, обеспечить надежное улавливание стружек вокруг винта, и хорошо пропылесосить и материнку и корпус после извлечения.
Ни в коем случае не допускать попадания стружек под чипы и слоты на материнке.