Если вам нужно просто измерять скорость пользователей то:
var sTime = new Date().getTime();
$.get( "file.php", function( data ) {
var fTime = new Date().getTime();
var time = (fTime - sTime)/1000;
var speed = Math.floor(data.length/1024/time);
alert(speed + "Kb/sec");
// Отправляем speed через AJAX на сервер
});
<?php
// Если файл на другом домене расскоментируйте след. строку
//header('Access-Control-Allow-Origin: *');
readfile("100mb.iso");
?>
Если вам нужно знать скорость с которой пользователи скачивают файлы с вашего сайта то можете взглянуть на то как происходит скачивание с mega.co.nz (С помощью Filesystem API в Chrome/Firefox и через Flash для не поддерживающих эту технологию браузеров).
habrahabr.ru/post/112286