Все решилось отключением Hardware Offload в настройках проблемного порта eth4 (в настройках порта бриджа, в который входит eth4). Причём на остальных выключено уже было (это дефолтное я так понимаю значение). Почему включилось на eth4, не знаю, сам я не включал.
/interface/bridge/port/set bridge=bridge1 interface=ether4 hw=no

Я вообще не понимаю, какая связь с тем, что отключение eth3, решало эту проблему, бо hw=yes - это включение обработки на процессоре свитичнга в микротике. Если кто пояснит, буду благодарен.