Без разницы как устанавливать. Sata и Slim Sata только физически по размерам отличаются, в адаптере только соединение дорожек от одного разъема к другому без всяких сложных схем. Для БИОС оба Sata одинаково равноценны.
PS: Вполне возможно различие в версии поколения Sata. На оптическом приводе может быть версия по старее - Sata II, а на HDD - Sata III. На саму возможность подключения любого Sata устройства это не влияет, а на скорость его работы - влияет.