Serbi, удалите с рабочего стола папку .git (она возможно скрытая), это и есть ваш репозиторий.
Создайте для проектов отдельную папку, например c:/dev и уже в ней работайте.
Serbi, если имя файла содержит пробелы, заключайте его в кавычки. Иначе это выглядит как несколько имён файлов и гит их конечно не находит.
Но в вашем случае надо всё-таки создать репозиторий внутри каталога проекта с не в корне рабочего стола.