С расстояниями до 90 м не будет проблем, если вы выбираете медный кабель, 0.52мм2. Не экономьте на кабеле, снизите стоимость владения. Откажитесь от -k2/16p, камеры подключенные к нему вы не увидите на других регистраторах, и 16-портовый свич будет дешевле встроенного в регистратор.
Используйте h265, ваше оборудование это позволяет.
У вас >40 камер, убедитесь что аплинки действительно GE.
У вас около 50 устройств, советую написать таблицу с именем и адресом каждого, до того как вы их купите, тем более начнете строить. Наладка начинается всегда в excel.
Если ваша сеть разбросана по зданию, которое не обойти за пол часа, поставьте вместо sg108 какой ни будь управляемый zyxel или лучше catalyst, сможете хоть припомнить, в какую сторону идти за пропавшей камерой.
Последнее, что вы имеете сказать под "...таким образом перекидывать архивы с регистратора на сервер компании..."? Объясните вашу потребность, в комментариях, обсудим, может подскажу чего.