SSLCACertificatePath должен указывать на путь, где лежать сертификаты
и их хэшированные линки, которые создаются командой:
ln -s somecert.crt `openssl x509 -hash -noout -in somecert.crt`.0
В разных местах я видел разные файлы со скриптами, которые создают линки по всему каталогу.
SSLCACertificateFile должен указывать на файл, где подряд идут PEM-формы сертификатов CA - без пробелов, без текстовых частей. Апач довольно капризен, лучше не экспериментировать.