Фирма вкладывает в Ваше обучение деньги, естественно, она не хочет вкладывать деньги впустую, поэтому практика нередкая. Можно поторговаться о сроках (все же 2 года слишком большой срок), можно поторговаться о возврате неполной суммы, если будете увольняться, например, через год. И обязательно добавьте в договор, что возврат только при увольнении по Вашей инициативе, а не, например, по соглашению сторон или по сокращению.
Ну и сами смотрите, собираетесь ли Вы два года еще работать в этой фирме?
Отдельно отмечу, что отказ от обучения из-за требования отработать два года на фирме может быть расценен отделом кадров как намек что Вы собираетесь увольняться, вроде как не лояльный к компании сотрудник, и сами попросят уволиться. Так тоже бывает.