Есть старый сайт, ТИЦ 20
Хотели сказать ИКС?
Т. е. вы делали новый сайт на поддомене старого?
Если так, то надо было закрыть от индексации поддомен в robots.txt и еще на всех страницах прописать метатеги rel="noindex". И делайте себе спокойно.
Но падение позиций может быть не из-за этого. Обычно в таких случаях поисковики склеивают и все. Причина может быть в другом.