В официальных источниках от Google и Яндекс никогда не встречал, что для СЕО нужно шаблон именно покупать, так что вряд ли именно отсутствие факта покупки плохо влияет на сео. Я продвигал несколько проектов на подобных "сэкономленных" шаблонах, в целом было всё как обычно.
На низкие позиции может влиять масса причин:
- то что, в принципе это шаблон, а не уникальный дизайн (поисковики любят всё уникальное)
- в бесплатном архиве могут быть какие-то левые ссылки на левые сайты, другие уязвимости (надо смотреть в панелях вебмастеров раздел безопасность и исходящие ссылки)
- откровенно слабый контент
- банально огромная конкуренция в нише и регионе
- низкая скорость, плохой хостинг
- возможно, решили сэкономить на сеошнике (как с шаблоном), и сами сделали оптимизацию (плохо продумали структуру, не собрали запросы, не выбрали из них самые эффективные, неправильно отправили на индексацию и т.п.)
Но вряд ли это именно некупленный шаблон.