Насколько я понимаю в PKI, нужен соответствующий криптопровайдер (например,
КриптоПРО CSP), на основе которого создается шаблон сертификата и выдаются готовые серты. На рутовом ЦС, наверное, лучше эксперименты не проводить, а на подчиненном ЦС - запросто
У КриптоПРО даже
тестовый УЦ на винде доступен