Не дочитал до конца. Какая-то каша. Сначала застопорился вот на этом.
Группа1 и Группа2 различаются по обнаружению качественного признака Х.
Что это означает?
Что вы отнесли элементы в группы по значению этого признака? Ну например - "мужчины/женщины"? "Больной/Здоровый" и пр? Отлично. Так можно. Но вот вопрос, а как тогда вы формировали "Контроль"?
Идем дальше.
В свою очередь каждая группа делится по срокам эксперимента.
Делится? Или все таки у каждого объекта снимаются показатели, но делается это многократно, то что вы назвали "по срокам эксперимента"? Т.е. для каждого объекта на самом деле имеем не параметры "перем1, Перем2, Перем3, Перем4" а параметры "перем1_в момент1, Перем2_в момент1, Перем3_в момент1, Перем4_в момент1,перем1_в момент2, Перем2_в момент2, Перем3_в момент2, Перем4_в момент2,перем1_в момент3, Перем2_в момент3, Перем3_в момент3, Перем4_в момент3,......."
Идем дальше.
доказать, что в Группе2, значения перем1, перем2, Перем (i) отличаются от Контроля и Группы1 - Вопрос - на какой момент?
Далее:
Различие на разных сроках эксперимента внутри группы делал Краскел-Уоллес.-вы хотели проверить, изменяется-ли значения по времени? Могу предположить, что у вас эксперимент по введению двух лекарств, а контроль - это плацебо. Тогда это имеет смысл, но если контроль это "здоровые" - тогда непонятна цель делать этот анализ внутри группы контроля.
Далее:
Сделал корреляционный анализ внутри каждой группы, выявил в части параметров связь в количественных переменных. - цель этого шага и корреляцию чего с чем внутри группы вы измеряли?
Ну, если ответите, то может и получиться подумать и что-то посоветовать.