Так очень сложно понять. Приведите html-код страницы и css. Тогда будет понятнее, а так, приведенный вами код должен работать.

echo $arRes["NAME"];

$arRes - это массив с разделами, если функция CIBlockSection::GetList отработала правильно.

А вообще возьмите себе вот такую функцию для дебага и вывода массива на экран, мне помагает всегда:

/**
     * @param array $what
     * @param bool $exit
     *
     * Вывод массива на экран.
     * Если $exit равен true - завершаем выполнение.
     */
function pre($what, $exit = false)
    {
	    if(count($what) == 0){
		    echo "array is empty";
		    return false;
	    }

        echo '<pre>';
        print_r($what);
        echo '</pre>';
        if($exit) exit;
    }

У вас может php работать под пользователем, у которого нет прав на изменение файлов на сервере. Какой хостинг?