Если нужен именно массив, то создать его в php, перевести в json и полученное представление поместить в атрибут, а по клику достать его оттуда, передать в JSON.parse() и работать с полученным результатом. Если нужно передавать элементы массива отдельно, то точно так же, как у вас уже сделано:

<?php if (!empty($images)): ?>
          <?php foreach($images as $img): ?>
          <?php 
            $name = pathinfo($img['filename'], PATHINFO_FILENAME);
            $ext = pathinfo($img['filename'], PATHINFO_EXTENSION);
          ?>
          <a href="#modal-order" data-toggle="modal" data-img="/uploads/<?php echo $img['filename']; ?>" ></a>
          <?php endforeach; ?>
        <?php endif; ?>

Если вы пишете что-то на чистом php то воспользуйтесь include('myselect.html'); или require('myselect.html');, если используете какие-то фреймворки, то зависит от того, что вы используете, если чистый html - используйте SSI (Server-Side Includes): <!--#include file="myselect.html"--> .