Разумеется опасно.
Вы бы ещё спросили, опасно ли давать ключи от дома незнакомцу на улице.

Смарт в норме (по крайне мере что попало в скриншот), а вот со свободным местом очень плохо.
SSD нельзя заполнять больше 75%, дальше скорость может падать катастрофически.
Попробуйте удалить 100 ГБ, подождите когда сработает TRIM и проверьте.

Есть нет папки, то ни как, только полная переустановка.