> "Также иногда приходится какие-то папки удалить с диска и закачать их заново (т.е. поменялась структура или еще что-то и не хочется ничего дублировать или мешать)."
Есть множество утилит, которые выполняют синхронизацию. В том числе и одностороннюю, чтобы не мучаться с тем, что удалять а что перезаписывать. Я пользуюсь nnbackup для создания копии нужных папок на периодически подключаемом внешнем usb диске - один раз настроил, с переписью нужных папок, сделал ярлык, с тех пор подключил - кликнул, отключил. Очень доволен.
> "Вопрос 2: влияет ли на диск его периодические полные форматирования? (простой тулзой из ОС). "
Полное форматирование вообще не нужно - оно не несет ничего полезного, кроме разве что секурного удаления данных, но с ними лучше работать по-другому. А так - просто потеря времени и электричества.
Если же вы опасаетесь за размагничивание информации, то с вашими данными это не произойдет и перезаписывать нет смысла, по двум следующим причинам:
1) 99% гораздо раньше выйдет из строя электроника, механика, раздолбаются разъемы, устареют стандарты интерфейса. Сама магнитная запись на винте, если его хранить в приемлимых условиях (отсутствие физического воздействия, перепада температур, давления, влажности, что вполне обеспечивается хранением в обычном сухом шкафу) - хранится несколько десятков, если не сотен лет.
2) 1% размагнитятся сервисные метки низкоуровневых секторов, которые были нанесены еще на заводе. Низкоуровневого форматирования сейчас уже нет, а эти метки никакими тулзами не переобновляются, следовательно сперва размагнитятся они. а затем уже ваша инфа, записанная гораздо позже.
