1. Куплен дополнительный ПК с емким (mATX на 6 HDD) корпусом с простым железом под файлопомойку. Настроены сетевые папки, AD, распределены права (дома 2 пользователя - я и моя жена) доступа, жесткие объединены в рейд 10, куплен ИБП и настроено автоматическое выключение в случае просадки батареи. Дальше - иерархия папок - отдельно фото, отдельно книги, отдельно видео, отдельно архивы. Фото объединяю в группы и подписываю папки - дата + событие, видео и дистрибутивы - в каждой папке лежит веб-страница с описанием. Шара лежит на сервере на рейде, бэкап этого всего, правда, делается не правильно, т.е. по сети на емкий диск на основном ПК по LAN, т.е. это сути - не правильно, но с другой стороны внешний диск покупать сейчас денег нет, да и интерфейс USB 2.0 не слишком шустрый, ИМХО, для терабайтных объемов.
2. OneNote и Evernote хороши, удобны, но у вики функционал выше. Виртуалка с XWiki на Glassfish + Oracle и вперед. Менее удобно чем тот же OneNote, но больше возможностей. Мне это более важно, чем удобство.
3. Спустя годы я понял, что миграция это хорошо, но надежнее все же в файлик. Статьи сортирую на виртуальном жестком диске, который периодически подключаю. Не самый оптимальный вариант, но я начал сохранять статьи когда еще OneNote и Evernote еще в проекте не было, по-старинке и работаю. В принципе браузер открывает в оффлайн режиме без проблем. Поиск - обычный стандартными средствами ОС.
4. Ручной режим, да, удобнее RSS и подписки, подписки кстати есть, но в некоторый момент объем становится слишком большой и требует слишком много времени. Я не сторонник того что бы входящей инфы было больше чем ты способен прочесть ее (проанализировать). По-этому несколько сайтов + пара форумов... Если остается время и желание читаю больше, просто пляшу от некоторого минимума, а не пытаюсь объять необъятное.
Статьи - сохраняю сразу страницей, видео/софт - на жесткий и опять же к нему сохраняю описание. Наиболее важную инфу + личный дневник - в вики, но по сути мне не хватает интеграции wiki-движка в ОС, а так же поддержки тегов, описаний и т.п. файловой системой.