я бы начал с чистки автозагрузки в реестре и в реестре же посмотрел бы на userinit, который в winlogon - вдруг после него еще что-то прописалось? курит в безопасном режиме и avz неплохо исключают зловредов. если вы перенесли систему на другое железо, возможно, было бы неплохо накатить соответствующие драйвера (чипсет там, все такое)? а такая шляпа происходит у всех пользователей, или только у одного основного? а система изначально ставилась с нуля или агрейдилась? а это не зверь_двд?
УПД десятка же следит за пользователями - вы отключали ей это и прочее логирование?

Может быть, вы её устанавливали от имени администратора (типа от пользователя просто так прав не хватило и ввели логин\пароль админа, кстати, а работаем вообще в домене или прям дома в единственном числе?) и потом от него же и запустили первый раз (часто не снимают галку "запустить ПО" в финальном диалоге установки и жмакают далее)? В этом случае всякие настройки могли прописаться в файле, доступ к которому будет только у администратора. И при последующем запуске _уже от имени простого юзверя_ Если есть возможность, попробуйте переустановить. Или дать полные права на каталог и\или конфижный файл программы для конкретного пользователя (вы пишите, что права уже дали, но, возможно, они не унаследовались?)

Переподключить мышь-клавиатуру в другие порты (если USB). Если не USB (а кругленькие с ножками внутри), то проверить, в те ли порты включены (обычно клавиатура - в синий, мышь - в зеленый). Будете вытыкать-втыкать кругленькие - не повредите ножки, они хливкие. Если "вчера работало, а щас нет", подключить другие мышь-клавиатуру.