pomeo

Это не уровень nodejs, это проще на уровне линуха сделать

Логи веб сервера поглядите, там будет скорей всего всё что вам нужно. Чего и как залили. А залили webshell скорей всего.

Ну так у вас ссылка на видео кривая vipst.hol.es/Untitled_converted.mp4/video/025422_c...

Корзину проверьте ~/.local/share/trash

у вас здесь r_pass = "" || email = "" присваивание, а не сравнение

Вы под рутом запускаете ноду(127.0.0.1:801)? Не хорошо это

Запустите апач или nginx, крутите rewrite как хотите. А browser-sync запустите с параметром proxy, где будет адрес апача или nginx

6. На DO вообще кроме виртуалок ничего нет.
Есть отдельные сервисы, но они стоят каких-то космических денег.

ctrl+alt+F1?
tail -n 200 /var/log/lightdm/lightdm.log или чего там у убунты сейчас, gdm ещё
tail -n 200 /var/log/Xorg.0.log или даже так cat /var/log/Xorg.0.log | grep EE

у browsersync есть настройка proxy

ну так есть же эта текущая страница с примером, загляните в её исходник, всё там есть
https://github.com/callemall/material-ui/blob/mast...

var browserSync = require('browser-sync');
var reload = browserSync.reload;
gulp.task('browser-sync', function() {
  browserSync.init(null, {
    proxy: 'vagrant',
    port: 8080
  });
});
gulp.task('default', ['browser-sync'], function () {
  gulp.watch(['src/**/*.less'], reload);
});

Так и хочется вставить картинку "бритва оккама", вы какую проблему решаете?
Во-первых jquery надо подключать с любого cdn, у вас должна быть причина, которую вы точно знаете, для чего вы его кладёте в проект.

Как вариант, разместить в проекте папку bower_components и в .html файлах ссылаться на файлы из неё, но тогда размер проекта вырастает колоссально (больше чем в 4 раза).

Какая разница сколько он там на диске занимает, если вы через script src подключаете только минифицированные версии.

С помощью Grunt научился объединять и сжимать файлы. Результат можно закинуть в другую папку, но правильно ли я понимаю, что в таком случае все остальные файлы - аудио, картинки, html - придется копировать в ручную. А потом в .html файлах подключать сжатые файлы скриптов и стилей?

Зачем что-то копировать?

В идеале, хотелось бы получить копию моего проекта, где отдельно сжаты файлы для index.html: index.js+get.js. И для popup.html: popup.js+popup-constructor.js+<все файлы из bower исключая jQuery>, popup.css+<все файлы из bower>.
И чтобы в данных .html файлах автоматически подключились только что сжатые файлы.

Сожмите сразу index.js+get.js+popup.js+popup-constructor.js=app.js(например), всё что у вас в bower скорей всего лежит на cdn каком-нибудь, на https://cdnjs.com точно есть

Вот где у вас domain:"localhost" попробуйте точку впереди localhost, т.е. domain:".localhost"