MongoDB устанавливается отдельным пакетом в AWS.
Подробные инструкции и рекомендации здесь
docs.mongodb.org/ecosystem/platforms/amazon-ec2
У них была раньше
готовая сборка, но сейчас она недоступна.
Вам нужно выбирать EBS-Optimized Instances.
t2.micro будет OK, если база маленькая (меньше 1GB реальных данных).
Хорошие рекомендации здесь
dba.stackexchange.com/questions/19491/mongodb-ram-...
Из опыта работы рекомендую выбирать объем памяти не меньший, чем двухкратный размер индекса. Идеальный вариант - размер данных + индексы.