Nol Chetyre

Будем называть вещи своими именами. Проблема чаще всего решается пивом админу. Если проблема так не решилась, то это не админ, а ...... (тут слово которое часто применяют к людям нетрадиционной ориентации в матерном варианте). Ограничение чаще всего могут быть по причине:
1. узкого канала
2. неадекватности вышеупомянутого кадра
3. долбонутости руководства (которая так думает повысить продуктивность работы)
4. кривых рук красноглазика. который начитался про крутость линукса и поставил его на шлюз. и не вкуривает что такое динамическое распределение ширины канала на одновременно работающих в интернете.

Никак.
Вообще на работе нужно работать, а не файлы качать.
Если вам это нужно по работе обратитесь к системному администратору.

тыц

Ни в коем случае не ставить никаких ISP Manager / Vesta / CPanel, иначе никогда не научитесь тому, чему хотите научиться. Кроме того, они жрут ресурсы. Даже Vesta, которая самая легкая, их жрет прилично, а я сильно сомневаюсь, что у вас VPS c 8+ Gb памяти.

Изучать надо по урокам и статьям, читая мануалы и best practices по каждому package. Порядок, плюс-минус, таков:

- развернули ось
- сделали сразу апдейты
- создали и настроили swap
- поменяли пароль рута на что-нибудь супер-мега-сложное (его мы использовать все равно не будем)
- создали себе обычного юзера с паролем нормальной сложности (он будет использоваться для sudo)
- дали юзеру права sudo
- закрутили гайки по SSH - сменили порт, запретили вход руту и вход по паролю (только по ssh-ключам), разрешили вход только одному своему новому логину
- настроили UFW - простой, но эффективный firewall на основе iptables - default deny, allow http, https, свой кастомный ssh-порт. Если логиниться будете только из нескольких мест (офис, дом) - можно вообще ssh разрешить только на эти IP.
- sudo dpkg-reconfigure tzdata чтобы установить свою временную зону, так логи потом легче читать и понимать
- настроили logrotate
- настроили logwatch
- настроили Postfix, чтобы сервер вам письма мог слать (мы его настраиваем на внешний мейлер, например Mandrill, чтобы все письма точно в спам не падали)
- настроили fail2ban (потом, после установки и настройки веб-сервера и сайтов, в fail2ban можно дополнения писать, например мы на WordPress-сайтах мониторим попытки авторизации в админку и блочим тем же fail2ban)
- дальше ставим все что нужно - Git, Nginx, HHVM, PHP5-FPM, MariaDB, Memcached/Redis и так далее.

Регулярно заходите на сервер, делайте apt-get update && apt-get dist-upgrade.

p.s.: это по ubuntu/debian, для других систем все то же самое, но packages и команды могут немного отличаться

В основном для централизованной аутентификации.

Задавайте конкретные вопросы - будут конкретные ответы.

способа ввода пароля от сервера

Ключи, ни каких паролей, только ключи.

до написания больших и объёмных программных кодов

Учите vim

разработке больших приложений

Работайте в команде или ищите рецепт бессметрия, одиночка физически не потянет большие приложения.

составления плана работы

Классика тайм мененджмента:
Делаем срочное важное, для делания срочного не важного нанимаем помощника, не забиваем на не срочное важное, не срочное не важное не делаем.

времени работы (если график свободный)

По своим биологическим часам, у меня продуктивность рано с утра и поздно вечером, днем не работаю, как у вас известно только вам.

цели работы

Сами думайте, мне просто моя работа нравится, сам процесс.

Советую прочитать Томас А. Лимончелли "Тайм-менеджмент для системных администраторов"
Вопрос прямо в тему книги.