Антивирус нужен везде где вы имеете дело в не контролируемыми данными. Все.
Если в вашу систему могут попасть или пройти через нее данные от не доверенных систем и антивирус умеет с данным типом данных работать, то он нужен.
Например
1) у вас есть NTP сервер, вы получаете время из не доверенной системы и раздаете его не доверенным системам. Но антивирус не умеет работать с NTP протоколом. Значит не нужен.
2) у вас FTP, вы получаете файлы от не доверенных систем и отдаете, антивирус умеет работать с файлами, значит нужен.
3) у вас прокси, он стоит за другим прокси управляемым вами, вы вышестоящий прокси считаете доверенной системой, антивирус на нижестоящем прокси не нужен.
Этот вопрос никак не связан с ОС сервера, ответ одинаков для любой операционной системы.