Иван Мельников, для этого неплохо бы понять насколько это нужно в данном случае.
Сколько iops выполняется, сколько могут диски в софтовом рейде, какие значения cpu wait.
А это разве не говорит, что он уже установлен?
mysql-server-5.7 is already the newest version (5.7.24-0ubuntu0.18.04.1).
Для клиента устанавливается пакет mysql
avp dnepr Вот здесь, например, написано, что можно сделать шаблон домена python-приложения или какого-то другого. Более подробно, думаю, в оф. документации панели.
физический сервер или vps?
smartmontools установлена?
если проблема аппаратная, то в dmesg смотри вывод на наличие i/o errors, если нет, то fsck в помощь.