Через API? https://vestacp.com/docs/api/
Не знаешь как из python get, post отправить?
С помощью библиотеки requests можно.
Если из Vesta, то в кроне свой скрипт можешь добавить.
avp dnepr Вот здесь, например, написано, что можно сделать шаблон домена python-приложения или какого-то другого. Более подробно, думаю, в оф. документации панели.