Приложения уже написали: Obsidian/Notion (первое приятнее, удобнее)
Но судя по описанию проблемы могу посоветовать не отвлекаться на подобное усердное накопление заметок: если за десятки лет это не приносило таких больших неудобств, что даже не задумывался над приложением для заметок, то:
1. Вряд-ли оно тебе понадобится
2. После его получения ты большую часть своего времени будешь тратить на форматирование и другую ненужную работу - пустая трата времени
Советую перестать быть настолько сердобольным и начать фильтровать свои заметки, чтобы только самое нужное под рукой было