$notFound = array();
foreach ($new_data as $k => $v)
{
	if (isset($data[$k])) $data[$k] = $v;
		else $notFound[$k] = $v;

}

иногда всё в разы проще =)

Не пробовали через модуль больших чисел GMP? Когда-то с ним игрался — RSA пишется влегкую

www.php.net/manual/ru/book.gmp.php

Попробуйте вот это:

function minifyCSS($string)
{
	/* Strips Comments */
	$string = preg_replace('!/\*.*?\*/!s','', $string);
	$string = preg_replace('/\n\s*\n/',"\n", $string);

	/* Minifies */
	$string = preg_replace('/[\n\r \t]/',' ', $string);
	$string = preg_replace('/ +/',' ', $string);
	$string = preg_replace('/ ?([,:;{}]) ?/','$1',$string);

	/* Kill Trailing Semicolon, Contributed by Oliver */
	$string = preg_replace('/;}/','}',$string);

	/* Return Minified CSS */
	return $string;
}

Успешно использую во всех проектах.

1) вырезать регулярными выражением все скрипты — очевидно
2) вырезать стили — чтобы свои контролы не ставили поверх наших
3) вырезать/дополнять_префиксами классы и id из html-элементов — чтобы клиентские элементы не могли использовать «наши» стили и обработчики