entermix

Вы можете хэшировать пароль используя метод hash_password
https://github.com/kohana/auth/blob/3.3/master/cla...

echo Auth::instance()->hash_password('new password')

https://stackoverflow.com/questions/4248068/genera...

Множество сайтов все еще используют Kohana, однако работы становится все меньше и меньше.
https://trends.builtwith.com/websitelist/Kohana
https://www.wappalyzer.com/technologies/kohana

Мир PHP шагнул далеко вперед. Разработчики не рекомендуют использовать Kohana для новых проектов:

discourse.kohanaframework.org/t/kohana-retirement-...
https://github.com/kohana/kohana/issues/110

Но если проект уже существует или Вы осознаете риски, вот активный форк:
https://github.com/koseven/

Любой опыт полезен, но стоит ли тратить время, чтобы изучать этот фреймворк - решать только Вам. К примеру одно дело изучать его за копейки, а потом не применить знаний, а другое дело получать хорошие деньги при этом расширить кругозор / помочь сообществу.

Поему Class 'Model_role' not found на рабочем linux?

Потому, что Вы не соблюдаете соглашение об именовании классов и файлов

Ну и соответственно при вызове:
$roles = ORM::factory('Role')->find_all();

Ну сделайте with и не будет 2-х запросов, в чем проблема?

Вот так сделайте:

Route::set('manager-catalog', 'manager/catalog(/<controller>(/<action>(/<id>)))')
->defaults(array(
    'directory' => 'manager/Catalog', // !
    'controller' => 'categories',
    'action'     => 'index',
));

Как то так:

Контроллер:

class Controller_Index_Account extends Controller_Index
{
    public function action_index()
    {
        $user_id = $this->request->param('id');
        ...
    }
}

Роут:

Route::set('index_account', 'id(/<id>)', ['action' => '(index)',])->
defaults([
        'directory' => 'index',
        'controller' => 'account',
        'action' => 'index',
    ]);

kohanaframework.org/3.3/guide/kohana/routing

Ну вообще как то так (если используете Kohana ORM):

<? $categories = ORM::factory('Category')->find_all(); ?>

<ul>
<? foreach ($categories as $cat): ?>
    <li><a href="/category/<?= $cat->alias; ?>" title="<?= $cat->name; ?>"><?= $cat->name; ?></a></li>
    <? if ($cat->subcategories->count_all() > 0): ?>
        <li>
            <ul>
            <? foreach ($cat->subcategories->find_all() as $subcategory): ?>
                <li><?= $subcategory->name; ?></li>
            <? endforeach; ?>
            </ul>
        </li>
    <? endif; ?> 
<? endforeach; ?>
</ul>

Но по Вашему коду видно, что там массив, а тут телепатов нету поэтому хз что Вы там передаете в шаблон.

1. Инициализируйте сессию:
$this->session = Session::instance();
перед тем, как делаете:

$this->auth = Auth::instance();
$this->user = $this->auth->get_user();

2. Используйте $this->request->query()/$this->request->post() вместо $_GET/$_POST

По вопросу, проверьте есть ли у пользователя роль login

И зачем в классе Controller_Index_Auth вы используете Auth::instance()->logged_in(), если омжно обращаться через $this->auth ?

А вы проверяли то, что в находится в $post после этой строчки ?

if ($post = $this->request->post())
    {

Проверьте настройка редактора кода, возможно там по умолчанию установлен ANSI

Для Kohana есть готовый модуль для реализации постраничной навигации (не идет с коробки)
https://github.com/shadowhand/pagination

Сохраняйте в БД UNIX TIMESTAMP, а на сайте выводите дату при помощи JS, например таким JQuery плагином