Мало информации.
Не ясно, какая структура у $jsonFileUser.
И не ясно, что возвращает rand_check($rand_id, $jsonFileUser).
Также термин "добавлять" можно трактовать по-разному.
Но попробую применить
телепатические способности. Если orders массив:
$jsonFileUser[$_SESSION['email']]["orders"][] = $content;
Однако, скорее всего, orders у вас - это ассоциативный массив. Тогда сложнее. Надо извлечь ключ из $content и использовать для индексации:
$jsonFileUser[$_SESSION['email']]["orders"][array_keys($content)[0]]=$content;
