В то же время этот файл могу успешно запустить руками с терминала ОС.
удостовериться в запуске с новыми настройками"имеется в виду что процесс запущен и работает и может при подмене конфигов не прописано поведение перезапуска или подгрузки новых конфигов. Может процесс подвис и его нужно убить принудительно при применении конфига