VoidVolker

Просто попробуйте обе и выберете для себе более приятную и удобную в работе.

Пробовал через GetCursorPos, однако он берёт за основу координаты всего рабочего стола, а не окна OpenGL, так же не совсем понимаю каким образом преобразовывать координаты от GetCursorPos в координаты OpenGL.

Конвертацией системы координат - для этого потребуется еще положение и размер окна.

filereader->FileReader__("J:\\фукрпкявамчс\\content\\Загрузки\\table.bmp","r");
  filereader->ReadFile(960*495*4,NewData);

Формат BMP полностью документирован и описан — готовых библиотек полно. Так что либо используйте готовый код для чтения файла либо реализуйте самостоятельно. Данный формат поддерживает палитры, а цвет пикселя может быть от одного до 64 бит (т.е. до восьми байт). В данном случае явно происходит некорректная интерпретация данных о цвете. Кроме того, он еще и заголовок содержит, в котором полностью описана вся информация об изображении и формат пикселя, и которая в данном коде полностью игнорируется. А еще там строки выравниваются по степени четверки - так что в любом случае все пиксели читаются в два цикла (второй - вложенный).

Ну, тут алгоритм на самом деле очень простой:
Встретилось непонятное слово/термин -> Загуглил -> Разобрался с его применением / сделал пару упражнений на применение -> Читаем дальше.