У меня когда-то был ноутбук ACER (года эдак 2007 выпуска). Я накатил на него Убунту. Он стал греться, гудеть и вырубаться, причём явно это было связано с перестановкой ОС.
Я случайно заметил, что есть заметно более новый БИОС. Но вот обновлялка биоса работала только под Виндоус. Пришлось охлаждать комп пылесосом через открытый корпус и грузиться через Reanimator CD. Потом обновлять биос. И, что странно, помогло.
По теме. Тут вроде и я не планку температуры поднял, но проблема с охлаждением решилась программно.