Stalker_RED

В зависимости от серьезности ваших намерений и требуемой надежности:
file_get_contents
или curl
или guzzle

Это сюр какой-то. Доступ к БД украли инопланетяне?

Ну вот регулярка, например https://regex101.com/r/TuQdqY/1/
Или почитай про какой-нибудь парсер нормальный, типа dom-crawler, DiDom или zend_dom_query

Какую выдачу?

Попробуйте воспользоваться дебаггером, можно хоть построчно исполнять код и вживую смотреть как что меняется.
Вот какое-то рандомное видео с демонстрацией https://www.youtube.com/watch?v=SA_0ZncpSGI

Попав в коллектив и получив список реальных задач вы сразу начнете сыпать вопросами "а как это сделать" или "а это что хоть такое то". И это безусловно уровень junior, потому что middle уже может почти все делать самостоятельно.

Дальше двигаться в сторону ООП, познакоимться с PSR и каким-то фреймворком (laravel или Symfony).
При этом можете начинать искать работу джуном уже прямо сейчас.

Какие способы, инструменты или может действия вы предпринимаете когда попадаете в патовую ситуацию?

Прежде всего - гуглю. Примерно в 80% случаев на первой странице выдачи находится годный материал, который остается только прочесть и осмыслить. Еще 19% ответов найдутся, если немного переформулировать вопрос.

Я вот представил, что я вижу совершенно непонятный для себя заголовок, про обход дерева. Первым делом я бы наверно загуглил так: "программирование что такое дерево". И после беглого ознакомления со страничкой в вики я бы наверное поплевался бы на местный "канцелярский" язык, и погуглил бы более прицельно: "обход дерева для чайников" или "обход дерева на пальцах". И бинго - вот они вменяемые обучающие материалы, где все довольно понятным языком изложено, и остается это все только прочесть и понять.

У вас сейчас сервер настроен на единую точку входа - index.php. Но похоже, что вы не умеете этим пользоваться.

Убрать не сложно: просто удалите вот эти строки с rewrite***.
Хотя круче было бы научиться с этим работать, потому что это уже много лет назад стало чуть ли не стандартом разработки.

Потому что в каком порядке вы их получили, в том вы и вставляете, и неважно какой if сработал.

Как вариант - вынести их в массив и применить какую-то из функций сортировки.

whois домена может изменять регистратор (может есть в админке, или по запросу, или может ваш регистратор этим не занимается, и придется его сменить).

Вообще-то прямо над этой строчкой есть комментарий, в котором написано что происходит.

Ну да, комментарий не идеален. Он не объясняет ЗАЧЕМ это делать, а это важно.
А еще автор кода возможно забыл о существовании touch(). Или fclose(fopen($file, "a+b")); делает что-то более хитрое?

У меня есть отличный план. Чтобы это плюсование не жрало ресурсы предлагаю вообще его не делать.
А вместо этого записывать дату покупки улучшения, и когда пльзователь захочет взглянкуть на свою циферку просто рассчитывать текущее значение по формуле по формуле.
Типа

базовое_значение + (прошедшее_время * значение_бонуса)

Алгоритм шинглов, например

Или, как вариант - делаем обоим строкам trim, разбиваем по пробелам, куски складываем в один массив, убираем дубликаты, склеиваем через пробел.

Каждый консюмер периодически обязан подать признаки жизни - в некую таблицу БД записывать дату и время активности.

Кажется, вы близки к тому, чтобы изобрести gearman.

Если делать самоделку, то обычно воркер беря задачу отмечает в таблице время старта и свой pid, и время завершения. И какой-то watcher проверяет таски которые слишком долго в работе и перезапускает.

Проще всего рассчитывать цену каждый раз при выводе.

количествоПрошедшихДней = текущаяДата - СтартоваяДата
скидка = количествоПрошедшихДней * 4
итоговаяСумма = стартоваяСумма - скидка