Kubuntu превращается в Ubuntu и наоборот легким движением руки
sudo apt-get install ubuntu-desktop
sudo apt-get --purge remove kubuntu-desktop
sudo apt-get autoremove
или
sudo apt-get install kubuntu-desktop
sudo apt-get --purge remove ubuntu-desktop
sudo apt-get autoremove
https://help.ubuntu.com/community/FromUbuntuToKubuntu
Можно просто сделать sudo apt-get install ubuntu-desktop и на экране входа в систему выбирать, что грузить - "Kubuntu" или "Ubuntu".
А по поводу загрузки с flash накопителя - не важно какая система стоит уже - вариантов два - или флешка не загрузочная (включая сюда проблемы с secureboot), или приоритет загрузки неправильный.
И то и другое в процессе загрузки диагностируется и пишется на экране.