Не очень понимаю, каким образом "урок по разработке большого проекта" поможет Вам разобраться в проекте компании, который пишут уже больше года.

Лучший учитель - практика. Применяйте новые знания на практике.
От того, что вы сделаете "большой проект" под копирку по уроку, мозгов не прибавится. Придумайте что-то свое и в путь

Используйте метод flat

$('li').click(function(e) {
  e.preventDefault();
  let text = $(this).attr('data-value')
  $('input').val(text)
})

$('li').click(function(e) {
  e.preventDefault();
  let text = $(this).find('a').text();
  $('input').val(text)
})

arr.key3 = val
arr['key4'] = val
Object.assign(arr, {key5: val})