Можно использовать
sender, можно агента, можно любой внешний скрипт, SSH, да что угодно, zabbix очень гибкая система мониторинга, конкретизируйте задачу, как человек смотрит на эти контрольные точки? Что за программу надо мониторить, под какой OS и так далее, без конкретики советовать сложно, но у zabbix отличная вики, начните знакомство с системой с нее.