АртемЪ

Для начала - SMART диска.
Если с ним все нормально - проверяем память.

Можно ли создать «дерево» виртуальных машин?

Можно.

Изменение "почек" не влияют ни на корневую ни на соседние машины,

Так и есть.

изменение корневой применяется ко всем "почкам".

Нет, изменения любой ОС, в том числе и корневой применяются только к ней самой, и ни к кому более.

Купить в магазине и обновить.

Периодически на компе вылезает синий экран на пару секунд и комп сам перезагружается.

В чём может быть проблема и как это решить?

Проблема явно в поврежденных системных файлах. Они могут повредится из за некорректной работы программ, из-за ошибок файловой системы, или неисправного диска.

1. Проверить SMART системного диска и поменять диск если он плохой. crystaldiskinfo.ru.uptodown.com/windows
   
2. Если SMART нормальный - проверить файловую систему на системном диске. chkdsk C: /f /offlinescanandfix
   
3. Проверить целостность системных файлов и исправить при необходимости sfc /scannow
   

Да, работать будет.
Возможны некоторые мелкие проблемы из за наличия в сети десятка абсолютно одинаковых машин, но они легко решаются.

Покупаете в магазине обычную кнопку и два проводка, прикручиваете проводки к купленной кнопке с одной стороны, и к кнопке RESET компьютера с другой стороны.
Все.

У вас похоже неправильный подход, мониторинг такого уровня, для разруливания данной ситуации просто не нужен.

пропускную способность канала увеличили до 15Мбит\сек, однако это не решило проблему медленной скорости приложений требующих соединения с интернетом

Надо понимать, что у разных приложений разные требования. И далеко не всегда нужна именно пропускная способность канала.
Например RDP может очень быстро работать работать на канале 256Кбит\с и ужасно тормозить на канале 100Мбит\с. Поэтому что для этого приложения важна задержка - тут надо пинг смотреть, и приоритеты настраивать, а масштабирование ширины канала тут никак не поможет.
То же самое касается большинства программ удаленного доступа, голосовой связи.

Все остальное - либо подключаем канал достаточной ширины, чтобы все пролазило, либо настраивать шейпинг, по пользователям, либо по приложениям, тут уж от требований конкретной ситуации зависит.

Зачем такой анализ того, кто куда, и когда ходил, и какую нагрузку создавал в конкретный момент времени?

Так мне через пару дней без уведомления просто заблочили сервер. И мурыжили еще несколько дней

Логично.
Владельцы сервера рассчитывают на определенную нагрузку, если нагрузка больше чем они ожидали начинаются проблемы. Если они сдают сервер под рабочий стол, то они никак не ожидают потоковой записи на диск.

Скрины с установленным софтом не помогли.

Логично, было бы удивительно, если бы помогли.

Ну все хорошо, но добавление дискового пространства (SSD не нужен) в разы увеличивает стоимость.

Естественно. Вы же берете не файловое хранилище - там дисковое место копейки стоит, вы берете удаленный рабочий стол - это предполагает что дискового пространства должно быть немного, но это должны быть очень быстрые диски.

В общем стоит пересмотреть требования - если нужен рабочий стол, то зачем много дисков?
Если нужно много дисков - непонятно для чего нужен рабочий стол.
А если все-таки нужно и то и другое, да еще и с поддержкой, то думаю бюджет стоит пересмотреть.

Как устанавливать Windows и активировать чтобы не было нарушения лицензии?

Читайте лицензию, и не нарушайте.

Понятное дело что ключом, но что если его нет?

Нет никакой разницы ключом, или активатором, как угодно.

в каждом городе есть множество магазинов и сервисов которые занимаются переустановкой Windows, как-то же они работают.

Делается это очень просто или не нарушаете закон, или не попадаетесь.
Вот и все.
Кстати особо обратите внимание на то что нельзя нарушать в первую очередь закон, а уж если нарушили, то не попадаться.
Лицензию нарушать во многих случаях можно, особенно если осторожно.

Скорее всего загрузку держит какое-то задание запланированное при загрузке.

Из легкого и простого - штатный монитор ресурсов, штатный брандмауэр.
Из более специфического и серьезного - wireshark, локальный прокси, можно с MITM, чтобы данные посмотреть.

Как создать бэкап лицензии Windows 7 и восстановить систему в режиме обновления без геморроя?

Лицензия это юридический документ, храните его в сейфе. Или попросите дубликат у правообладателя.

Если вас интересует восстановление системы без потери активации и установленных программ - храните образ системы.
Создается с помощью стандартных средств резервного копирования Windows.

и эти программы иногда удаляют то, что потом приходится очень даже нужным

Эти программы по сути вредоносный софт, и те кто ими пользуются сами себе злобные буратино.

В общем, поставили систему, нужный софт, обновления, драйвера, активировали - сняли образ системного диска и храните его.
В любой момент откатываетесь на нужное состояние.
Так же неплохо обновлять его - раз в месяц, полгода, год.

Потом установил дрова и базовые приложения типа клинера, проигрователя. И после этого при загрузке перед приветствие он начал зависать на черном экране на 20 - 30 сек.

Ну понятное дело что причина в этом.

Откуда дровишки ставили? С официального сайта производителя ноутбука скачали? - в этом случае проблем быть не должно.
А вот если дровишки скачаны из любого другого места - это нормально, так и должно быть.
С приложениями та же ситуация, установив пару проигрывателей, можно незаметно поставить на систему кучу вредоносного софта вроде ccleaner, парочку майнеров, и десяток троянов.

образ же нужно создать с помощью вот этого самого софта

Ну так штатные инструменты резервного копирования и создания образа присутствуют в windows начиная с висты.

Следовательно нужно что бы было хоть какое-то сжатие данных, что бы раздел диска С:\ не 100гб образ создавал, а допустим те 46ГБ занятых.

Ну вы же не посекторный образ снимать будете? Поэтому образ буде не больше занятого места, плюс еще сжатие моет быть.

По поводу стандартного бекапа инструментами винды - я не разобрался, и не понял, слишком уж много проблем как по мне, и многое спрятано от глаз

Да вроде все открыто и довольно просто, и проблем при развертывании ничуть не больше чем в том же акронисе.

Еще как вариант - банальная утилита от Руссиновича - Disk2Vhd
Разворачивать Vhd2Dsk, или прямо с образа запустить винду.

Зачем? Не проще ли зарегистрировать бесплатный аккаунт и получить установленный на хостинге вордпресс?

Поискав по просторам сети нашёл вариант смены через BIOS интерфейса SATA на AHCI, однако это не дало результатов

Это нужно было сделать в любом случае, ибо полноценного использования диска без AHCI не будет.

В чем проблема непонятно, без диагностики, может и диск, хотя маловероятно, может проблема в другом железе.
Вероятнее всего так работает сама Windows - нужно смотреть чем она занимается в момент подвисания.

В общем посмотрите SMART диска, и посмотрите нагрузку в момент подвисаний.