Семён Воронов

Попробуйте выполнить вручную команду sync после копирования, но не уверен что проблема в этом.

Веб-интерфейс Evernote?
Вообще имхо Evernote очень большое, тормозящее зло, отвратительно работающая с копированием, вставкой. Альтернатив к сожалению не знаю. Что ни пробовал - все не то. Остановился на заметках в обычных файлах оп средствам vim-a и их синхронизации через dropbox/mail-cloud.

Если загрузчик Grub - убедитесь в установленном пакете os-prober и зависимостях для него. В этом случае команда grub-mkconfig -o /boot/grub/grub.cfg успешно найдет и Ubuntu, и Android, и Windows 7. Предварительно забэкапте файл grub.cfg

Если слетел полностью весь загрузчик перед выполнением команды выше установите загрузчик на устройство выбранное в bios в качестве загрузки по умолчанию. Пример:
grub-install /dev/sda

В поисках волшебной палочки?
Сидите и разбирайтесь, документации полно, читайте. Не беритесь сразу за сложное. Если что то не понятно начинайте с азов, применяйте на практике, собирайте тестовые стенды, практикуйтесь. С повышением квалификации будут открываться дополнительные возможности - к примеру смена места работы.
Полно курсов, если нету денег за свой счет учиться - пытайтесь за счет работодателя, нет - ресурсы типа складчик или торренты. Делите систему на компоненты и их разбивайте на составляющие.
Подпишитесь на интересные ИТ-блоги по линукс системам и блоги вендоров типа IBM и RH. Читайте ту же хабру.
Почитайте резюме человека кем бы вы хотели стать.
Вносите вклад в развитие линукс сообщества. Улучшайте продукты...
Как можно вообще такие вопросы задавать? Все очень очевидно. Нужно лишь желание и интерес.

Можно получать логи вызова любых системных команд через библиотеку snoopy (snoopy logger).
Установка очень проста. Логика работы тоже. Это ELF библиотека которая загружается перед выполнением любых исполняемых программ.

По логированию screen взгляните на этот пост

Используйте на сервере nginx с функцией proxy_pass.

Не стоит забывать что многие дистрибутивы одной линейки с разными оболочками отличаются друг от друга различными утилитами, которые разрабатывает конкретно их сообщество. Но это далеко на самый первый критерий.
Линукс - очень модульная система. Большинство пользователей, скажем так, "чистюли". Для человека пришедшего с Windows по началу, возможно, это сложно понять, но в основе этого лежит принцип разделяемых библиотек . Проще говоря различные пакеты Linux не изобретают костылей и не повторяют однообразный код, уже реализованный в другом пакете. Все что делается - подключается нужный фунционал из них. Это крайне мощный механизм, позволяющий не только сократить время на разработку, но и увеличить чистоту и качество кода (человеческий фактор никто не отменял), быстродействие, производительность с уменьшением размера пакетов и это тот факт который делает линукс таким масштабируемым.
Именно в силу этих особенностей дабы не тянуть кучу не нужных библиотек засоряя систему пользователи выбирают конкретную уже готовую реализацию нужно им дистрибутива с той оболочкой которую используют они.

Вопрос очень специфичный, потому что все зависит конкретно от вашей архитектуры приложения и что не менее важно - от правильности выбора настроек и оптимизации системы. Конкретно рекомендации: использование VDS, VPS очень даже рентабельно. Большинство хостингов смогут обеспечить вас возможностью масштабирования мощностей без каких либо усилий. При нехватке ресурсов можно просто перелезть на более мощную архитектуру. Так же многие хостинги обеспечивают надежность хранения данных по средствам бэкапа (снапшоты или же место на резервном хранилище).
Могу порекомендовать ru.hetzner.com - зарекомендовавший себя хостинг и наверно один из самых популярных.
Не стоит забывать что для домашнего сервера сложно обеспечить должную отказоустойчивость - отключение света, проблемы с интернетом. А так же ежемесячные дополнительные затраты на электричество и широкую стабильную полосу интернет.
По вопросу выбора ОС - конкретно что то рекомендовать не имеет смысла. Вот тут человек ниже отговаривает вас от FreeBSD. Основания?

просто на линуксе все работает быстрее это раз
админиться и ставится в 10 раз легче это да

Складывается впечатление что просто руки не из того место растут. При должном навыке на любой системе все будет отлично работать. Я не пропагандирую FreeBSD, для подобных задач использую Debian. Но система это всего лишь инструмент в руках специалиста, а инструменты выбирают под конкретную задачу. Поэтому выбирайте ту ось, в которая будет лучше отвечать вашим требованиям и проще для администратора который будет ее настраивать и оптимизировать.

0. tar корня
1. dd
2. Clonezilla
3. rsnapshot

help.ubuntu.ru/wiki/backup - тут полный ответ

Посмтори в сторону параметров

net.ipv4.tcp_slow_start_after_idle=0
net.ipv4.netfilter.ip_conntrack_max=524288
net.netfilter.nf_conntrack_tcp_timeout_established=600
net.ipv4.netfilter.ip_conntrack_tcp_timeout_time_wait = 1

net.ipv4.tcp_slow_start_after_idle
net.ipv4.netfilter.ip_conntrack_max
net.netfilter.nf_conntrack_tcp_timeout_established - TCP сессии не держать 5 дней (432000 по умолчанию)

Т.к. ты создаешь скрипты в /var/prtg/scripts они удаляются после ребута скорее всего потому что каталог временный и находится в оперативной памяти.
Проверь: mount --types tmpfs
Попробуй создать скрипт в другом месте, не в /var

Что бы маршруты не терялись добавить их нужно в конфигурационный файл /etc/network/interfaces, а лучше отдельным скриптом в /etc/network/if-up.d/

perl -i -ne 'print unless $a{$_}++' access.log

Используй предназначенную для автостарта скриптов директорию
/etc/network/if-up.d/
Подробней man interfaces или тут

Zabbix,
Nagios,
Munin,
Cacti,
OpenNMS,
Zenoss,
Ganglia,
Riemann,
Foglight NMS,
Pandora FMS,
NetXMS,
Xymon,
Opmantek NMIS,
Icinga,
Sensu,
MRTG,
Collectd,
Splunk

....

Из личного опыта советую присмотреться в приоритете соответственно к Zabbix, Nagios, Sensu, Cacti

Достаточно просты в освоении, очень разнообразный функционал, простота сбора данных и написания своих модулей.