А я вот бы отговорил вас использовать 1С. У меня есть опыт работы с разными небольшими интернет-магазинами, так вот 1С для них всегда было слишком много и слишком сложно. Техподдержки нет, приходится привлекать программиста.
Если вы привыкли к веб интерфейсам и логике которую дают современные web-сервисы с 1С вам будет тяжело работать.
Я бы предложил по максимуму вести учет в вебе, в 1С только налоги и бухгалтерия. Благо 1С бухгалтерия удобна и понятна для бухгалтеров.
Но если вы говорите, что уже ведете налоговый учет, не понятно почему не можете вести учет взаиморасчетов там же?
Вот писал сравнение УНФ и УТ, посмотрите.
https://ut11-bitrix.ru/raznoe/ut-11-vs-unf/
Мое резюме попробовать найти решение в вебе. Если уже ничего не получится, то тогда 1С.