В вашем случае проще взять готовый образ VM zabbix у них на сайте и сделать базовую настройку. Когда освоитесь установите полноценно.
Инфраструктура средних размеров - это сколько? Для меня это от 150 хостов
Про отличия есть спец статьи где все сравнивается и обосновывается, Вы бы для начала погуглили, почитали, и только потом задавали сюда вопрос