Само по себе это не уменьшает вашу безопасность, её уменьшает неправильная настройка. PhpMyAdmin можно перенести на другой адрес или ограничить к нему доступ только для определённых IP и всё, нет проблем. Всё в ваших руках.
Думаю ваша проблема в том, что вы пытаетесь сразу прыгнуть на 2D/3D не освоив азов. Калькулятор на С++ сами с нуля сможете написать не используя чужие коды и наработки?