ffmpeg
for %%a in ("*.mp4") do ffmpeg.exe -y -i "%%a" -stream_loop -1 -i "D:\logo_new_1.png" -map 0:0 -filter_complex "[1:v]fade=in:st=0:d=1.5:alpha=1[FID2];[0:0][FID2]overlay=main_w-overlay_w-1580:main_h-overlay_h-900:repeatlast=0" -c:v h264_nvenc -b:v 9000k -s 1920x1080 "D:\1234\%%~na.mp4"
h264_nvenc - использовать карту nvidia
b:v - битрейт
-s - разрешение
*.mp4 - взять из папки(из которой запускается скрипт) все файлы формата mp4
этот bat скрипт поместить в одну папку с exe от ffmpeg, файлы с видео, ну и пути свои проставить
в скрипте жестко задано расположение логотипа, как сделать "плавающий" я не осилил, место наложение подберешь эмпирическим путем, на любом тестовом видео)
overlay_w
overlay_h
- куда размещать лого, ширина \ высота в пикселях