Фига се ВПСка... вы там ядерные модели будете просчитывать?))
Либо провайдер чет режет(например скорость в европу) ну или ТСПУ у прова не успевает расшифровать трафик))
Либо проверяйте загрузку ЦП у микротика
Попробуйте pptp или опенвпн
У меня с РТ такая фигня была. Пока опенвпн со своим серт на 443 порту не настроил - скорость в ноль резалась(